Molecular Technique

   การตรวจวินิจฉัย DNA/RNA ของไวรัสจากสิ่งส่งตรวจด้วยเทคนิค PCR/RT-PCR, และ  Branch DNA Hybridization

   การตรวจ  Viral Genotyping   ด้วยวิธี  DNA sequencing

   การตรวจวินิจฉัย DNA/RNA ของไวรัสจากสิ่งส่งตรวจด้วยเทคนิค Real-Time PCR

   การตรวจวินิจฉัยหาเชื้อ HPV DNA ด้วยเทคนิค Hybrid Capture Technology

   การเก็บตัวอย่างส่งตรวจ

 
More Information

ติดต่อ             หน่วยไวรัสวิทยาและจุลชีววิทยาโมเลกุล ภาควิชาพยาธิวิทยา                       

                       คณะแพทยศาสตร์ ร.พ. รามาธิบดี มหาวิทยาลัยมหิดล
โทรศัพท์ : 201-1324, 201-1470, 201-2115
Mobile phone    อ.วันทนิช  : 09-2014132 , อ.วิโรจน์  : 01-8068368
โทรสาร     : 201-1324, 201-1470
E-mail    : rawct@mahidol.ac.th
Website : http://www.virusrama.org
 

การตรวจวินิจฉัย DNA/RNA ของไวรัสจากสิ่งส่งตรวจด้วยเทคนิค PCR/RT-PCR และ Branch  DNA Hybridization

 

      

 สิ่งส่งตรวจ

Cobas Amplicor

     bDNA

ชนิดไวรัส

สิ่งส่งตรวจ

Qualitative

Viral load

Viral load

CMV

EDTA Blood 5ml, CSF, Urine, BAL,เชลล์, ชิ้นเนื้อ

ได้ผลใน 1-3 วัน

*EDTA Blood

ได้ผลใน 1-3 วัน

*EDTA Blood

 

HCV

EDTA Blood 5ml

ได้ผลใน 1-3 วัน

ได้ผลใน 1-3 วัน

ได้ผลใน  1 สัปดาห์

HBV

EDTA Blood 5ml

 

ได้ผลใน 1-3 วัน

ได้ผลใน 1 สัปดาห์

HIV

EDTA Blood 5ml,เซลล์

ได้ผลใน 1-3 วัน

ตรวจ viral RNA

ได้ผลใน 1-3 วัน

ตรวจ viral RNA

โปรดระบุวิธีตรวจ

 *   Standardค่าต่ำสุด 400 copies/ml

 Ultrasensitive ค่าต่ำสุด 50 copies/ml

 

 

การตรวจ Viral Genotyping ด้วยวิธี DNA Sequencing
 

ชนิดไวรัส

สิ่งส่งตรวจ

Sequence based genotyping

การนำไปประยุกต์ใช้

HIV

FDA approved

EDTA Blood 5ml

โปรดเลือก

  RT

  Protease

RT + Protease

หมายเหตุ

*       HIV-1 ที่ส่งมาตรวจ genotyping ควรมี viral load > 2,000 copies/ml

*       กรณีที่ตรวจ genotype ไม่ได้จะทำการตรวจ viral load ชดเชย

Drug resistance assay

HCV

EDTA Blood 5ml

5’ Non Coding Genotyping

แสดงผลได้ทุก type & subtype

หมายเหตุ

*       HCV ที่ส่งมาตรวจ genotyping ควรมี  viral load > 2,000 copies/ml

*       กรณีที่ตรวจ genotype ไม่ได้จะทำการตรวจ viral load ชดเชย

Drug resistance assay

HBV

EDTA Blood 5ml

แสดงผลการกลายพันธุ์ที่ตำแหน่งต่างๆ

Drug resistance assay

HPV

เชลล์, ชิ้นเนื้อ

L1  region

แสดงผลได้ทุก type & subtype

Disease management

 

 

การตรวจวินิจฉัย DNA/RNA ของไวรัสจากสิ่งส่งตรวจด้วยเทคนิค Real-Time PCR
 

  สิ่งส่งรวจ

Super Speed, Real-Time PCR (LightCycler)

ชนิดไวรัส

สิ่งส่งตรวจ

Qualitative

Typing

Viral load

HSV

EDTA Blood 5ml, CSF, BAL, Vaginal Swab, Vitreous Fluids (น้ำจากตา)

ได้ผลใน 24 ช.ม.

แสดงผล + หรือ พร้อมทั้ง

Typing (บ่งชี้ Type 1 หรือ  2)

ได้ผลใน 24 ช.ม.

CMV

EDTA Blood 5ml, CSF, Urine, BAL,เชลล์, ชิ้นเนื้อ

ได้ผลใน 1-2 วัน*CSF, Urine, BAL

 

ได้ผลใน 1-2 วัน

*CSF, Urine, BAL

EBV

EDTA Blood 5ml,เชลล์, ชิ้นเนื้อl

ได้ผลใน 1-2 วัน

 

ได้ผลใน 1-2 วัน

VZV

EDTA Blood 5ml, CSF, Vesicles

ได้ผลใน 1-2 วัน

 

 

Dengue

EDTA Blood 5ml

ได้ผลใน 1-2 วัน

Type 1,2,3,4

ได้ผลใน 1-2 วัน

 

HCV

EDTA Blood 5ml

 

 

 

HBV

EDTA Blood 5ml

ได้ผลใน 1-2 วัน

 

 

HIV

EDTA Blood 5ml,เซลล์

ได้ผลใน 1-3 วัน

ตรวจ proviral DNA จาก PBMC

 

 

ได้ผลใน 1-3 วัน

ตรวจ proviral DNA จาก PBMC

 

HPV

เชลล์, ชิ้นเนื้อ

ได้ผลใน 1-2 วัน

ตรวจ wild type

ได้ผลใน 1-2 วัน

โปรดระบุ type ที่ต้องการตรวจ

6/11

16/18

  31/33/35

ได้ผลใน 1-2 วัน

 

การตรวจวินิจฉัยหาเชื้อ HPV DNA ด้วยเทคนิค Hybrid Capture Technology
 

ชนิดไวรัส

สิ่งส่งตรวจ

ข้อมูลพื้นฐาน

 

HPV

Cervical Specimen 

*       สามารถตรวจหาสายพันธุ์ 16, 18, 31, 33, 35, 45, 51, 52, และ 56 ของ HPV  Virus ซึ่งเป็นชนิดกลุ่มเสี่ยงที่มีโอกาสพัฒนาการเป็นมะเร็งปากมดลูกได้

 

 

การเก็บตัวอย่างส่งตรวจ PCR & Genotype assay
 

1.    การตรวจหา Viral Load และPCR ใช้ EDTA blood 5 ml หรือ ACD  (ห้ามใช้ heparin ) ส่งห้องแล็บเร็วที่สุด ถ้าไม่สามารถจัดส่งเลือดตามกำหนด ให้ปั่นแยก plasma 1,500 rpm 10 นาที เก็บ plasma โดย Sterile Technique แล้วแช่แข็งที่อุณหภูมิ 20 หรือ -70C นำส่งในกระติกบรรจุน้ำแข็ง (2-8oC)  กรณีส่งเลือดจากต่างจังหวัดหากไม่สะดวกที่จะปั่นแยก plasma ให้นำส่ง EDTA blood มาในกระติกบรรจุน้ำแข็ง (2-8 OC) ถึงห้องแล็บภายในเวลาไม่เกิน 6 ชั่วโมง โปรดแจ้งมายังหน่วยฯก่อนนำส่ง

2.    การตรวจหาเชื้อไวรัสโดยวิธี PCR จากตัวอย่างตรวจชนิดอื่นๆ เช่น  Liver, Lymphnode, CSF, urine และน้ำจากส่วนต่างๆของร่างกาย ควรเป็นหลอดใหม่ หรือ ภาชนะที่ผ่านการฆ่าเชื้อแล้ว (sterilization) 

3.    ตัวอย่างเลือดเพื่อการตรวจยีโนมไวรัส HIV ที่ดื้อต่อยาต้านไวรัส (Genotyping) ใช้ EDTA blood 10 ml หรือ ACD (ห้ามใช้ heparin )  ส่งห้องแล็บเร็วที่สุด ถ้าไม่สามารถจัดส่งเลือดตามกำหนด เช่น เจาะเลือดนอกเวลาราชการ หรือส่งจากต่างจังหวัด ให้ปั่นแยก plasma 1,500 rpm 10 นาที เก็บที่อุณหภูมิ –20  หรือ -70oC นำส่งในกระติกบรรจุน้ำแข็ง(2-8OC)  โปรดแจ้งมายังหน่วยฯก่อนนำส่ง